108대의 로이뮤드를 제거한 지 3개월이 흐른 어느 날, 초자연현상의 조사를 명령 받은 전진과 수현은 대천공사로 향한다. 슬기와 현진을 만나 사건 현장에 대한 자세한 내용을 들으려 하는데 안마가 유영의 이도검 아이콘을 빼앗아가고, 유영은 고스트로 변신하여 안마를 상대하지만, 안마가 보이지 않는 전진과 수현은 혼자서 마구 날뛰는 고스트가 초자연현상의 장본인이라고 오해한다. 그곳에 마하로 변신한 우현이 가세하여 고스트를 공격하고, 진성과 전진 역시 변신, 2대2의 싸움으로 번진다. 하지만 슬기가 반짝이를 쏘아 가면라이더는 안마를 쓰러뜨리고 유영은 이도검 아이콘을 되찾는다. 유영의 사정을 듣게 된 전진과 우현이 유영을 되살리는 데 협조하기로 한 그때, 모노리스가 작동하며 전진과 유영은 10년 전의 대천공사로 떨어지게 된다. 그곳에서 전진은 처음 알기 전의 벨트 씨와, 유영은 생전의 아버지와 만나게 된다. 그리고 아버지가 돌아가신 날이 가까워졌다는 것을 안 유영과 전진은, 그것을 저지하기 위해 움직인다. 한편, 두 사람이 과거로 건너간 탓에 10년 후인 현재가 변하고 마는데, 그 때문에 제거한 로이뮤드가 모두 되살아나게 되었고, 우현과 진성은 부활한 체이스와 함께 로이뮤드를 상대한다. 그리고 과거에서는 레오나르도 다 빈치 안마를 만들려는 라파엘로 안마와 미켈란젤로 안마에 의해 슬기가 납치되는 사건이 발생, 전진과 유영은, 용재와 어린 유영과 함께 슬기를 구하러 간다.